На главную страницу
Консервативные аминокислотные остатки в выборке 9 потенциальных
ортологов ,белка LolB_ecoli
Матрица попарного сходства (% совпадения)
последовательностей выборки ортологов
LOLB_ACTAC LOLB_HAEIN LOLB_PASMU LOLB_HAEDU LOLB_ECOLI LOLB_SALTI LOLB_YERPE LOLB_PHOLL LOLB_VIBCH LOLB_VIBVY
LOLB_ACTAC 100%
LOLB_HAEIN 58% 100%
LOLB_PASMU 60% 50% 100%
LOLB_HAEDU 42% 38% 43% 100%
LOLB_ECOLI 25% 22% 25% 23% 100%
LOLB_SALTI 25% 23% 26% 23% 91% 100%
LOLB_YERPE 24% 22% 26% 24% 63% 62% 100%
LOLB_PHOLL 24% 20% 25% 21% 55% 54% 62% 100%
LOLB_VIBCH 23% 21% 23% 22% 26% 27% 27% 25% 100%
LOLB_VIBVY 23% 22% 20% 23% 26% 26% 27% 24% 49% 100%
|
По заданию предлагалось сделать выборку белков в диапазоне от 50% до 75% identity,
но такого числа белков с данным identity не нашлось, поэтому диапазон был несколько
расширен.Один из изначально используемых имел процент сходства с остальными
больший 90%, поэтому был удален из выборки.
Множественное выравнивание выборки ортологов
Следующее выравнивание было сделано с помощью программы emma пакета Emboss.
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
4 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
6 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
8 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
O |
L |
B |
_ |
A |
C |
T |
A |
C |
  |
: |
  |
- |
- |
M |
K |
K |
L |
K |
S |
Y |
V |
L |
L |
V |
L |
A |
V |
L |
F |
L |
T |
A |
C |
V |
T |
D |
Q |
E |
R |
P |
T |
N |
V |
K |
Y |
I |
E |
K |
T |
D |
R |
T |
W |
Q |
Q |
H |
F |
T |
Q |
L |
K |
Q |
I |
Q |
G |
Y |
P |
A |
L |
G |
Q |
L |
G |
Y |
I |
S |
S |
K |
E |
R |
F |
S |
T |
R |
F |
D |
W |
Q |
Y |
N |
N |
P |
R |
D |
Y |
T |
L |
Q |
L |
Y |
S |
  |
: |
  |
  |
8 |
8 |
L |
O |
L |
B |
_ |
H |
A |
E |
I |
N |
  |
: |
  |
M |
N |
N |
M |
K |
T |
F |
K |
F |
F |
T |
A |
L |
F |
A |
T |
A |
I |
L |
T |
A |
C |
T |
L |
D |
M |
E |
R |
P |
T |
N |
V |
Q |
Y |
I |
D |
K |
T |
D |
A |
I |
W |
Q |
Q |
H |
L |
Q |
K |
I |
Q |
K |
I |
Q |
S |
Y |
Q |
A |
K |
G |
Q |
I |
G |
Y |
I |
S |
P |
T |
E |
R |
F |
S |
S |
R |
F |
E |
W |
Q |
Y |
Q |
N |
P |
K |
S |
Y |
T |
L |
K |
L |
Y |
S |
  |
: |
  |
  |
9 |
0 |
L |
O |
L |
B |
_ |
P |
A |
S |
M |
U |
  |
: |
  |
- |
M |
V |
M |
K |
K |
Q |
H |
F |
L |
L |
P |
I |
I |
A |
S |
F |
F |
L |
F |
A |
C |
T |
L |
D |
T |
E |
R |
P |
T |
D |
V |
K |
Y |
I |
S |
H |
T |
D |
P |
T |
W |
Q |
Q |
H |
L |
S |
Q |
L |
K |
K |
I |
R |
D |
Y |
T |
N |
Q |
G |
Q |
L |
G |
Y |
I |
S |
Q |
K |
E |
R |
F |
S |
T |
R |
F |
D |
W |
Q |
Y |
Q |
N |
P |
T |
N |
Y |
R |
L |
T |
L |
S |
S |
  |
: |
  |
  |
8 |
9 |
L |
O |
L |
B |
_ |
H |
A |
E |
D |
U |
  |
: |
  |
M |
K |
K |
S |
T |
L |
L |
F |
S |
L |
M |
A |
M |
A |
L |
S |
G |
C |
N |
S |
V |
L |
N |
A |
P |
I |
E |
V |
K |
K |
L |
V |
Y |
Q |
I |
E |
H |
T |
D |
P |
A |
W |
Q |
Q |
H |
L |
K |
Q |
L |
A |
E |
I |
K |
N |
Y |
E |
V |
K |
G |
Q |
F |
G |
Y |
I |
S |
P |
T |
E |
R |
F |
S |
A |
H |
F |
D |
W |
Q |
Y |
K |
T |
P |
I |
D |
F |
T |
L |
A |
L |
S |
S |
  |
: |
  |
  |
9 |
0 |
L |
O |
L |
B |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
- |
- |
- |
M |
P |
L |
P |
D |
F |
R |
L |
I |
R |
L |
L |
P |
L |
A |
A |
L |
V |
L |
T |
A |
C |
S |
V |
T |
T |
P |
K |
G |
P |
G |
K |
S |
P |
D |
S |
P |
Q |
W |
R |
Q |
H |
Q |
Q |
D |
V |
R |
N |
L |
N |
Q |
Y |
Q |
T |
R |
G |
A |
F |
A |
Y |
I |
S |
D |
Q |
Q |
K |
V |
Y |
A |
R |
F |
F |
W |
Q |
Q |
T |
G |
Q |
D |
R |
Y |
R |
L |
L |
L |
T |
N |
  |
: |
  |
  |
8 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
S |
A |
L |
T |
I |
  |
: |
  |
- |
- |
- |
M |
T |
L |
P |
D |
F |
R |
L |
I |
R |
L |
L |
P |
L |
A |
S |
L |
V |
L |
T |
A |
C |
T |
L |
P |
G |
H |
K |
G |
P |
G |
K |
S |
P |
D |
S |
P |
Q |
W |
R |
Q |
H |
Q |
Q |
E |
V |
R |
H |
L |
N |
Q |
Y |
Q |
T |
R |
G |
A |
F |
A |
Y |
I |
S |
D |
D |
Q |
K |
V |
Y |
A |
R |
F |
F |
W |
Q |
Q |
T |
G |
Q |
D |
R |
Y |
R |
L |
L |
L |
T |
N |
  |
: |
  |
  |
8 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
Y |
E |
R |
P |
E |
  |
: |
  |
- |
- |
- |
M |
P |
M |
R |
K |
R |
H |
F |
Y |
R |
L |
L |
P |
L |
A |
S |
L |
L |
L |
A |
A |
C |
T |
I |
P |
V |
S |
K |
G |
P |
A |
T |
S |
P |
T |
S |
P |
Q |
W |
R |
Q |
H |
E |
Q |
Q |
L |
Q |
Q |
L |
G |
Q |
F |
E |
T |
R |
G |
A |
F |
A |
Y |
L |
S |
D |
K |
Q |
K |
V |
Y |
A |
R |
F |
F |
W |
Q |
Q |
T |
S |
P |
E |
R |
Y |
R |
L |
L |
L |
T |
N |
  |
: |
  |
  |
8 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
P |
H |
O |
L |
L |
  |
: |
  |
- |
- |
M |
K |
P |
I |
Q |
K |
L |
S |
L |
F |
R |
L |
L |
P |
L |
S |
C |
V |
L |
L |
L |
T |
A |
C |
T |
L |
T |
Q |
P |
G |
G |
T |
G |
S |
A |
D |
S |
P |
Q |
W |
R |
A |
H |
T |
Q |
Q |
L |
Q |
Q |
L |
N |
Q |
Y |
Q |
T |
R |
G |
S |
F |
A |
Y |
L |
S |
N |
E |
K |
K |
V |
Y |
A |
R |
F |
F |
W |
Q |
Q |
Y |
H |
P |
E |
R |
Y |
R |
L |
L |
L |
T |
N |
  |
: |
  |
  |
8 |
8 |
L |
O |
L |
B |
_ |
V |
I |
B |
C |
H |
  |
: |
  |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
N |
A |
L |
V |
R |
R |
L |
L |
P |
G |
L |
A |
S |
L |
L |
L |
L |
A |
G |
C |
A |
T |
A |
P |
L |
Q |
P |
V |
N |
V |
Q |
W |
Q |
S |
H |
Q |
V |
T |
L |
E |
Q |
I |
Q |
H |
Y |
Q |
L |
T |
G |
K |
L |
G |
Y |
I |
A |
P |
D |
Q |
R |
Q |
S |
F |
N |
F |
Q |
W |
Q |
K |
S |
- |
P |
Q |
K |
L |
S |
L |
R |
L |
S |
N |
  |
: |
  |
  |
8 |
0 |
L |
O |
L |
B |
_ |
V |
I |
B |
V |
Y |
  |
: |
  |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
F |
R |
R |
T |
Y |
F |
W |
L |
M |
L |
L |
P |
L |
F |
M |
V |
G |
C |
T |
G |
L |
P |
D |
H |
P |
T |
S |
V |
E |
W |
Q |
S |
H |
Q |
A |
K |
L |
S |
Q |
I |
Q |
S |
F |
Q |
A |
V |
G |
K |
L |
G |
Y |
I |
S |
P |
D |
Q |
R |
Q |
N |
L |
N |
F |
Y |
W |
K |
H |
S |
- |
P |
E |
Q |
S |
N |
L |
R |
F |
T |
T |
  |
: |
  |
  |
7 |
8 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
W |
  |
  |
H |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
y |
  |
  |
  |
G |
  |
  |
  |
Y |
i |
s |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
F |
  |
W |
q |
  |
  |
  |
p |
  |
  |
  |
  |
L |
  |
l |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
0 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
2 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
4 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
6 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
1 |
8 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
O |
L |
B |
_ |
A |
C |
T |
A |
C |
  |
: |
  |
T |
I |
S |
S |
E |
T |
L |
Q |
I |
Q |
M |
H |
A |
Q |
G |
M |
T |
I |
S |
D |
N |
K |
G |
R |
Q |
R |
S |
A |
A |
D |
A |
K |
M |
L |
L |
R |
E |
I |
I |
G |
M |
D |
F |
P |
L |
E |
Q |
F |
A |
F |
W |
L |
K |
G |
Q |
P |
E |
D |
N |
A |
D |
Y |
Q |
V |
G |
E |
N |
H |
L |
L |
A |
T |
F |
S |
R |
T |
I |
D |
G |
K |
P |
W |
T |
A |
D |
Y |
L |
S |
Y |
H |
  |
: |
  |
1 |
7 |
8 |
L |
O |
L |
B |
_ |
H |
A |
E |
I |
N |
  |
: |
  |
L |
I |
S |
K |
S |
T |
L |
W |
I |
Q |
M |
H |
Q |
S |
G |
M |
T |
I |
S |
D |
N |
N |
G |
N |
Q |
Q |
S |
A |
A |
N |
S |
K |
L |
L |
L |
Q |
E |
I |
I |
G |
M |
D |
V |
P |
L |
E |
H |
L |
A |
Y |
W |
L |
K |
G |
Q |
P |
A |
M |
N |
A |
D |
Y |
Q |
V |
G |
T |
N |
H |
L |
L |
G |
A |
F |
T |
Y |
H |
V |
D |
G |
S |
Q |
W |
T |
A |
D |
Y |
L |
T |
Y |
H |
  |
: |
  |
1 |
8 |
0 |
L |
O |
L |
B |
_ |
P |
A |
S |
M |
U |
  |
: |
  |
T |
L |
S |
P |
T |
T |
L |
S |
I |
E |
V |
R |
H |
N |
V |
M |
H |
L |
S |
D |
N |
K |
G |
P |
L |
R |
S |
A |
Q |
D |
A |
K |
R |
L |
L |
K |
E |
I |
V |
G |
M |
D |
L |
P |
L |
D |
Q |
F |
A |
L |
W |
L |
K |
G |
Q |
P |
D |
E |
S |
R |
E |
Y |
R |
V |
A |
E |
N |
H |
L |
L |
A |
H |
F |
S |
Y |
P |
I |
D |
N |
Q |
Q |
W |
T |
A |
D |
Y |
L |
S |
Y |
H |
  |
: |
  |
1 |
7 |
9 |
L |
O |
L |
B |
_ |
H |
A |
E |
D |
U |
  |
: |
  |
N |
L |
S |
T |
K |
L |
L |
K |
L |
Q |
R |
S |
H |
Q |
G |
L |
T |
V |
S |
D |
S |
E |
G |
Y |
S |
R |
T |
E |
A |
D |
I |
H |
A |
L |
M |
Q |
E |
I |
I |
G |
V |
S |
F |
P |
I |
D |
Q |
F |
A |
Y |
W |
V |
K |
G |
Q |
P |
A |
Q |
E |
G |
N |
Y |
I |
V |
N |
E |
K |
R |
Q |
L |
S |
Q |
F |
S |
Y |
P |
I |
N |
Q |
Q |
I |
W |
Q |
A |
R |
Y |
V |
E |
Y |
H |
  |
: |
  |
1 |
8 |
0 |
L |
O |
L |
B |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
P |
L |
G |
S |
T |
E |
L |
E |
L |
N |
A |
Q |
P |
G |
N |
V |
Q |
L |
V |
D |
N |
K |
G |
Q |
R |
Y |
T |
A |
D |
D |
A |
E |
E |
M |
I |
G |
K |
L |
T |
G |
M |
P |
I |
P |
L |
N |
S |
L |
R |
Q |
W |
I |
L |
G |
L |
P |
G |
D |
A |
T |
D |
Y |
K |
L |
D |
D |
Q |
Y |
R |
L |
S |
E |
I |
T |
Y |
S |
Q |
N |
G |
K |
N |
W |
K |
V |
V |
Y |
G |
G |
Y |
D |
  |
: |
  |
1 |
7 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
S |
A |
L |
T |
I |
  |
: |
  |
P |
L |
G |
S |
T |
E |
L |
E |
L |
N |
A |
Q |
P |
G |
N |
V |
Q |
L |
V |
D |
N |
K |
G |
Q |
R |
Y |
T |
A |
D |
D |
A |
E |
E |
M |
I |
G |
K |
L |
T |
G |
M |
P |
I |
P |
L |
N |
S |
L |
R |
Q |
W |
I |
L |
G |
L |
P |
G |
D |
A |
T |
D |
Y |
K |
L |
D |
D |
Q |
Y |
R |
L |
S |
E |
V |
N |
Y |
H |
Q |
D |
G |
K |
N |
W |
K |
V |
V |
Y |
G |
G |
Y |
D |
  |
: |
  |
1 |
7 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
Y |
E |
R |
P |
E |
  |
: |
  |
P |
L |
G |
S |
T |
E |
L |
E |
L |
V |
V |
Q |
P |
G |
V |
T |
Q |
L |
T |
D |
N |
Q |
G |
K |
R |
Y |
V |
S |
D |
D |
P |
Q |
E |
M |
I |
Q |
K |
L |
T |
G |
M |
S |
I |
P |
L |
E |
S |
L |
R |
Q |
W |
I |
L |
G |
L |
P |
G |
D |
T |
S |
D |
F |
T |
L |
D |
D |
K |
Y |
R |
L |
K |
K |
L |
T |
Y |
Q |
Q |
N |
G |
V |
T |
W |
V |
V |
D |
Y |
Q |
E |
Y |
N |
  |
: |
  |
1 |
7 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
P |
H |
O |
L |
L |
  |
: |
  |
P |
L |
G |
S |
T |
E |
L |
E |
L |
I |
V |
Q |
P |
N |
M |
T |
Q |
L |
T |
D |
S |
Q |
G |
K |
K |
Y |
F |
S |
D |
N |
P |
E |
E |
I |
I |
Y |
Q |
F |
T |
N |
M |
D |
I |
P |
L |
D |
N |
L |
R |
H |
W |
I |
T |
G |
L |
P |
G |
D |
A |
K |
N |
F |
K |
L |
D |
A |
N |
Y |
L |
L |
K |
T |
V |
N |
Y |
Q |
Q |
N |
G |
A |
T |
W |
Q |
V |
N |
Y |
Q |
S |
Y |
D |
  |
: |
  |
1 |
7 |
8 |
L |
O |
L |
B |
_ |
V |
I |
B |
C |
H |
  |
: |
  |
F |
L |
G |
Q |
T |
V |
L |
N |
L |
Q |
V |
D |
E |
Q |
G |
A |
R |
V |
E |
T |
Y |
D |
D |
Q |
I |
Y |
R |
D |
Q |
D |
A |
Q |
S |
L |
I |
R |
N |
L |
T |
G |
L |
D |
I |
P |
V |
E |
Q |
L |
E |
D |
W |
I |
L |
G |
L |
P |
T |
Q |
A |
T |
H |
Y |
E |
L |
N |
E |
Q |
N |
T |
L |
A |
T |
L |
T |
K |
L |
A |
S |
T |
E |
E |
W |
H |
V |
E |
Y |
Q |
R |
Y |
Q |
  |
: |
  |
1 |
7 |
0 |
L |
O |
L |
B |
_ |
V |
I |
B |
V |
Y |
  |
: |
  |
F |
L |
G |
Q |
T |
A |
L |
N |
L |
T |
M |
T |
P |
Q |
G |
A |
R |
V |
E |
T |
Y |
D |
D |
Q |
I |
L |
T |
A |
A |
N |
A |
T |
A |
L |
V |
Q |
Q |
L |
T |
G |
L |
V |
I |
P |
V |
E |
Q |
L |
S |
D |
W |
I |
I |
G |
L |
P |
N |
G |
A |
D |
D |
F |
Q |
L |
N |
E |
Q |
N |
T |
L |
S |
S |
L |
E |
K |
D |
L |
N |
F |
Q |
R |
W |
H |
I |
A |
Y |
T |
Q |
Y |
R |
  |
: |
  |
1 |
6 |
8 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
l |
  |
  |
  |
  |
L |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
d |
  |
  |
g |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
g |
  |
  |
  |
P |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
W |
  |
  |
G |
  |
P |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
W |
  |
  |
  |
Y |
  |
  |
Y |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
2 |
0 |
0 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
* |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
L |
O |
L |
B |
_ |
A |
C |
T |
A |
C |
  |
: |
  |
V |
N |
R |
R |
P |
- |
- |
- |
- |
P |
M |
P |
E |
N |
I |
L |
L |
K |
T |
E |
G |
Q |
T |
L |
K |
I |
R |
V |
D |
E |
W |
L |
F |
- |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
H |
A |
E |
I |
N |
  |
: |
  |
S |
N |
N |
S |
M |
- |
- |
- |
- |
P |
E |
N |
I |
L |
L |
K |
N |
D |
S |
T |
K |
Q |
T |
L |
K |
I |
R |
V |
D |
E |
W |
I |
Y |
- |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
9 |
L |
O |
L |
B |
_ |
P |
A |
S |
M |
U |
  |
: |
  |
Q |
L |
P |
- |
L |
- |
- |
- |
- |
P |
L |
P |
K |
D |
I |
L |
L |
K |
T |
E |
G |
Q |
T |
L |
K |
I |
R |
I |
D |
N |
W |
T |
Y |
- |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
H |
A |
E |
D |
U |
  |
: |
  |
E |
N |
R |
V |
P |
- |
- |
- |
- |
Y |
L |
P |
K |
L |
I |
V |
L |
E |
N |
G |
Q |
Q |
T |
L |
K |
I |
R |
L |
D |
H |
W |
N |
Y |
- |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
9 |
L |
O |
L |
B |
_ |
E |
C |
O |
L |
I |
  |
: |
  |
T |
K |
T |
Q |
P |
- |
- |
- |
- |
A |
M |
P |
A |
N |
M |
E |
L |
T |
D |
G |
G |
Q |
R |
I |
K |
L |
K |
M |
D |
N |
W |
I |
V |
K |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
S |
A |
L |
T |
I |
  |
: |
  |
S |
K |
T |
Q |
P |
- |
- |
- |
- |
A |
M |
P |
A |
N |
M |
E |
L |
S |
D |
G |
S |
Q |
R |
I |
K |
L |
K |
M |
D |
N |
W |
I |
V |
K |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
Y |
E |
R |
P |
E |
  |
: |
  |
T |
Q |
V |
T |
P |
- |
- |
- |
- |
S |
L |
P |
S |
R |
L |
E |
L |
N |
Q |
D |
G |
Q |
R |
I |
K |
L |
K |
M |
D |
S |
W |
T |
I |
K |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
7 |
L |
O |
L |
B |
_ |
P |
H |
O |
L |
L |
  |
: |
  |
T |
S |
T |
T |
P |
- |
- |
- |
- |
A |
L |
P |
N |
R |
L |
E |
L |
I |
Q |
G |
D |
R |
R |
I |
K |
L |
K |
M |
D |
N |
W |
T |
T |
K |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
8 |
L |
O |
L |
B |
_ |
V |
I |
B |
C |
H |
  |
: |
  |
A |
I |
E |
W |
Q |
H |
Q |
P |
I |
P |
L |
P |
D |
K |
L |
K |
L |
Q |
Q |
N |
K |
T |
S |
I |
Q |
L |
V |
I |
S |
Q |
W |
T |
L |
L |
P |
  |
: |
  |
2 |
0 |
5 |
L |
O |
L |
B |
_ |
V |
I |
B |
V |
Y |
  |
: |
  |
D |
V |
E |
F |
H |
Q |
Q |
V |
V |
P |
L |
P |
A |
K |
L |
S |
L |
T |
Q |
Q |
D |
I |
K |
L |
N |
I |
V |
V |
S |
K |
W |
T |
L |
K |
- |
  |
: |
  |
2 |
0 |
2 |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
p |
  |
  |
  |
  |
l |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
k |
  |
  |
  |
d |
  |
W |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
  |
На фоне
расположены
консервативные на 100% аминокислотные остатки, а на
- консервативные на 80%.
3D-структура белка LolB_ECOLI с выделенными
консервативными остатками зоны связывания лиганда
Изображенная модель структуры белка, полученная с помощью программы
RASMOL, демонстрирует выделенные в виде ball-and-stick атомы и остатки,
находящиеся в радиусе 5 A от лиганда, лиганд в виде шариков красного цвета.
Зеленым цветом обозначены консервативные на 80% , а фиолетовым консервативные
на 100% остатки, расположенные в зоне контакта
Просматривая, модель структуры белка можно сказать, что в зоне контакта белка
есть консервативные остатки, но не так много, как ожидалось, что странно,
так как в зоне контакта должно быть много консервативных остатков, иначе при
многих заменах будет возможно то, что белок не сможет связывать лиганд. Но с
другой стороны, если смотреть на участок выравнивания, который предположительно
контактирует с лигандом, то можно сказать, что он гораздо более консервативен,
чем все остальные участки данного белка.
©
Хайруллина Гузель,2004